A metodologia de trabalho desenvolvida no curso de Licenciatura em Ciências Biológicas na modalidade EaD da Faculdade Única é pautada no princípio pedagógico da interdisciplinaridade e transdisciplinaridade, proporcionando a relação entre os temas específicos das disciplinas e as diversas áreas do conhecimento.
Considerando a nova concepção trazida pela Lei n.9.394/96 de “trabalho acadêmico efetivo” o curso prioriza a autoaprendizagem do aluno. Essa nova concepção busca a ruptura com o modelo tradicional de educação que condiciona a aprendizagem do discente a sua presença em sala de aula e à atuação do professor.